气相色谱质谱联用仪是开发最早的色质联用仪器，由于从气相色谱仪分离后的样品呈气态，流动相是气体，与质谱仪的进样要求相匹配，最容易将这两种仪器联用。气相色谱质谱联用仪综合了气相色谱仪和质谱仪的优点，弥补了各自的不足，具有灵敏度高、分析速度快和鉴别能力强的特点，可同时完成待测组分的分离和鉴定，可用于多组分混合物中未知组分的定性和定量分析，判断化合物的分子结构，准确测定化合物的分子量，对生物样品和体液中药物及代谢物进行痕量分析，对挥发性成分可直接进行定性和定量分析，对不挥发性成分和热不稳定的物质可进行适宜的衍生化再进行分析。气相色谱质谱联用仪已广泛用于兴奋剂检测、方剂研究和药动学研究等，应用范围越来越广泛。
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