一头猪的排泄量相当于5个人的排泄量，65万头猪的排泄量，就相当于现在厦门全市人口的排泄总量。如果养猪场无序发展、无组织排放、无配套病死猪无害化处理，其污染程度将是不言而喻的。
近年来，福建省厦门市岛外主要溪流受到污染，水环境质量从2009年开始普遍下降，部分小溪流出现劣Ⅴ类水体，黑臭现象严重，达不到水功能区划对水质的要求。据环保部门监测分析，造成岛外溪流水质严重污染的主要原因，正是大量的生猪养殖污染物排放。
为了整治养殖业给厦门带来的环境污染问题，厦门通过“集约化、资源化、无害化、生态养殖”等措施，开展生猪养殖整治。
厦门市环保局因地制宜，创新治理模式，分类指导：在山地多的地区，广泛推广猪—沼—果（草、林、菜）生态型养猪模式；在农林地面积较小的地区，大力推广达标排放环保型养猪模式；在改建的大中型猪场，积极示范推广漏粪地面—免冲洗—减排放养猪模式和生物发酵垫料床（异位）零排放养猪模式相结合的混合生态养殖模式；在有条件的猪场，积极推广应用生物发酵垫料床零排放养猪模式。
在厦门市环保局局长王文杰看来，在今后一段时间内，厦门市将突出3个重点：一是以抓农业生物技术及产业化为代表的知识经济的发展，培育新一代勇于开拓创新的龙头企业家；二是以抓低废、无废、循环利用技术及产业化为代表的生态农业，生产绿色食品和有机食品，提高企业在国际、国内市场的竞争力；三是引导农业企业开展ISO14000体系认证，申请绿色食品及有机食品标志，开通绿色通道，开拓绿色市场，带动绿色消费，促进绿色产业的可持续发展。
厦门市要求，虽然目前厦门岛外的4个行政区有一些养殖场处在限养区范围内，但是随着城镇化不断推进，未来有可能要退到限养区以外，也必须在规定的时间内，改造成生物发酵床零排放养殖模式。同时，要求目前地处限养区边缘地带的养殖场，也必须在规定时间内，改造成生物发酵床零排放养殖模式。
厦门确定，2015年——2020年，统筹考虑资源和发展要件，围绕保障本市居民基础供给和污染减排的总目标，进一步优化生猪养殖与污染治理监控模式，转变生猪养殖发展方式，加快建立完善规模化、标准化、生态化的现代生猪养殖基地。
