6月5日，国家环保部对外通报了《2016中国环境状况公报》。该《公报》里的“海洋环境状况”章节显示——南海2016年近岸海域水质为“良好”，一类海水比例为47.7%。中国9个重要河口海湾中，只有北部湾水质是“优”。
该《公报》指出：2016年，全国近岸海域水质基本保持稳定，水质级别为“一般”。417个点位中，一类海水比例为32.4%，比2015年下降1.2个百分点；二类为41.0%，比2015年上升4.1个百分点；三类为10.3%，比2015年上升2.7个百分点；四类为3.1%，比2015年下降0.6个百分点；劣四类为13.2%，比2015年下降5.1个百分点。主要污染指标为无机氮和活性磷酸盐。其中，南海2016年近岸海域水质为“良好”，一类海水比例为47.7%。黄海近岸海域水质为“良好”，一类海水比例为38.5%；渤海近岸海域水质为“一般”；东海近岸海域水质为“差”。
在9个重要河口海湾中，北部湾水质优，辽东湾、黄河口和胶州湾水质一般，渤海湾和珠江口水质差，长江口、杭州湾和闽江口水质极差。与2015年相比，辽东湾和珠江口水质好转，闽江口水质恶化，其他河口海湾水质基本稳定。
在全国2016年典型海洋生态系统环境状况中，中国4大珊瑚礁生态系统里，雷州半岛西南沿岸和广西北海的珊瑚礁为健康状况，海南东海岸和西沙珊瑚礁为亚健康状况。
