《方案》提出，在城市黑臭水体排查治理中，要尊重自然、顺应自然、保护自然，统筹上下游、左右岸、地上地下关系，重点抓城市环境基础设施建设、源头污染管控和体制机制建设；落实城市政府主体责任，全面推行河长制、湖长制；强化部门、区域协调和牵头部门、责任部门的联动，形成合力；畅通公众监督渠道，充分调动社会力量参与，扎实有力推动治理工作开展。
《方案》要求，各城市要定期组织开展专项普查，特别是对已掌握的水体污染情况和群众投诉举报情况，严格按有关检测指标再次进行评估确认；加快实施治理。对于排查出的新增城市黑臭水体，按照控源截污、内源治理、生态修复、活水保质的技术路线有序实施。
