根据《实施方案》，“一保”，指保护农村饮用水水源，确保农村饮水安全更有保障。“两治”，指治理农村生活垃圾和污水，实现村庄环境干净整洁有序。“三减”，指减少化肥、农药使用量和农业用水总量。“四提升”，指提升主要由农业面源污染造成的超标水体水质、农业废弃物综合利用率、环境监管能力和农民群众参与度。
《实施方案》明确了加强农村饮用水水源地保护、扎实推进农村污水垃圾治理、持续推动农业污染防治、提升农业农村环境监管能力等4方面近20项具体任务。提出加强市级统筹、落实属地责任、保障资金投入、完善经济政策、加强村民参与、培育市场主体等6方面的保障措施。到2020年，规模化养殖场畜禽粪污综合利用率达到90%以上，农膜回收率达到80%以上，农作物秸秆综合利用率达到98.5%。
北京市生态环境局相关负责人表示，下一步，将按照《实施方案》强化监督工作，把农业农村污染治理突出问题纳入市级生态环境保护督察范畴，对污染问题严重、治理工作推进不力的地区进行问责。
